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            天津本生解答:DNA提取方法的總結(jié)

            更新時(shí)間:2022-11-17    點(diǎn)擊次數(shù):2112

             

              天津本生解答:DNA提取方法的總結(jié)

             

              細(xì)菌DNA的提取:

              (一)

              試劑:

              1. 抽提緩沖液

              2% CTAB (W/V)

              2% PVP K25 (w/v) (去色素)

              100mM Tris-HCl (pH8.0)

              25mM EDTA (pH8.0)

              2.0M NaCl

              2.10M LiCl

              3. 2M LiCl

              4.DEPC-water(抑制RNA酶活性)

              5. 3M NaAc (pH5.2)

              6. 96% 乙醇

              7. 70% 乙醇

              細(xì)菌DNA的步驟:

              1.抽提緩沖液65℃預(yù)熱;

              2. 加菌體到已經(jīng)預(yù)熱的緩沖液(700ul)中混勻,65℃,10min;

              3. 加酚/LV仿/ywc(25:24:1),振蕩,離心12,000rpm,10min;

              4.取上清,加LV/ywc(24:1)振蕩,離心12,000rpm,10min;

              5. 取上清,重復(fù)4步驟;

              6. 加入1/10體積的3M醋酸鈉和1.5倍體積的乙醇(或加入等體積的ybc),-20C沉淀;

              11. 離心12,000rpm,10min;

              12. 棄上清,70%乙醇洗,也可以再用100%乙醇洗,然后溶解于100ml 水中。

              (二)(我們常用的方法,但是有時(shí)有些細(xì)菌特別不好提,就用上面的方法)

              1. 將菌株接種于液體LB培養(yǎng)基,37℃震蕩培養(yǎng)過(guò)夜。

              2. 取1.5ml培養(yǎng)物12000rpm離心2min。

              3. 沉淀物加入567 ul的TE緩沖液,反復(fù)吹打使之重新懸浮,加入30ul 10%SDS和15ul的蛋白酶K,混勻,于37℃溫育1h.

              4. 加入100ul 5mol/L NaCl, 充分混勻,再加入80ul CTAB/NaCl溶液,混勻后再65℃溫育10min。

              5. 加入等體積的酚/LV/ywc混勻,離心4-5min, 將上清轉(zhuǎn)入一只新管中,加入0.6-0.8倍體積的ybc,輕輕混合直到DNA沉淀下來(lái),沉淀可稍加離心。

              6. 沉淀用1ml的70%乙醇洗滌后,離心棄乙醇.

              真菌DNA的提取:

              (一)

              1.取真菌菌絲0.5g, 在液氮中迅速研磨成粉

              2.加入4mL提取液,快速振蕩混勻

              3.加入等體積的4mL的LV:ywc(24:1),渦旋3~5min(此處是粗提沒(méi)有加酚,可以節(jié)約成本的喲!)

              4.1000rpm,4℃,5min

              5.上清用體積的LV:ywc(24:1)再抽提一次(10,000 rpm,4℃離心5 min)

              6.取上清,加入2/3倍體積的-20℃預(yù)冷ybc或2.5倍體積的無(wú)水乙醇沉淀, 混勻, 靜置約30 min

              7.用毛細(xì)玻棒挑出絮狀沉淀, 用75%乙醇反復(fù)漂洗數(shù)次, 再用無(wú)水乙醇漂洗1次, 吹干,重懸于500 ?ulTE中

              8.加入1 ul RNaseA (10 mg/mL),37℃處理1 hr

              9.用酚(pH8.0):LV仿:ywc(25:24:1)和LV仿:ywc(24:1)各抽提1次(10,000 rpm,4℃離心5 min)

              10.取上清,1/10V 3M NaAc,2.5V體積的無(wú)水乙醇, -70℃沉淀30 min以上

              11.沉淀用75%乙醇漂洗,風(fēng)干, 溶于200 ulTE中,-20 ℃保存?zhèn)溆?/p>

              DNA提取液:0.2M Tris-HCl(pH 7.5),0.5M NaCl,0.01M EDTA,1%SDS,

              3M NaAc

              細(xì)菌DNA的細(xì)菌(二)

              1.真菌菌絲0.5-1 g, 在液氮中迅速研磨成粉

              2.加入3 mL 65℃預(yù)熱的DNA提取緩沖液,快速振蕩混勻65℃水浴30 min, 期間混勻2-3次

              3.加入1 mL 5M KAc,冰浴20 min

              4.等體積的LV仿:ywc(24:1)抽提1次(10,000 rpm,4℃離心5 min)

              5.取上清,加入2/3倍體積的-20℃預(yù)冷ybc, 混勻, 靜置約30 min

              6.用毛細(xì)玻棒挑出絮狀沉淀, 用75%乙醇反復(fù)漂洗數(shù)次, 再用無(wú)水乙醇漂洗1次, 吹干,重懸于500 ?L TE中

              7.加入1 ul RNaseA (10 mg/mL),37℃處理1 hr

              8.用酚(pH8.0):LV仿:ywc(25:24:1)和LV仿:ywc(24:1)各抽提1次(10,000 rpm,4℃離心5 min)

              9.取上清,1/10V 3M NaAc,2.5V體積的無(wú)水乙醇, -70℃沉淀30 min以上

              10.沉淀用75%乙醇漂洗,風(fēng)干, 溶于200 ul TE中,-20 ℃保存?zhèn)溆谩?/p>

             

              注:僅供參考!

             

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